Controversia reina sobre los efectos de los cultivos modificados genéticamente o alimentos de origen animal, cuyo progreso a través de la cadena alimenticia culmina en nuestra mesa. Otros temas de mayor preocupación es el efecto de contaminación genética a través del polen. Un agricultor es legalmente responsable si vende productos modificados genéticamente, incluso si no se da cuenta de la modificación. Los genes de maíz genéticamente modificados han sido encontrados en las cepas silvestres en el México rural. Hay pocos resultados disponibles de la investigación con financiación pública para realizar una evaluación en profundidad de las consecuencias.

La preocupación de los consumidores ha llevado a los principales minoristas de América en favor de los transgénicos se prohíbe el uso de alimentos modificados genéticamente en sus productos de marca propia en los mercados europeos. Desafortunadamente, las actuales normas de etiquetado no cubren la tecnología de enzimas en las etapas de procesamiento que es donde el uso de transgénicos está más generalizado.

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